2021年，南通市有各类医疗卫生机构3494个，比上年增加65个。其中，医院236个、基层医疗卫生机构3163个、专业公共卫生机构45个、其他卫生机构50个。236个医院中，综合医院134个、中医医院9个，中西医结合医院3个、专科医院53个、护理院37个。全市卫生机构拥有床位5.06万张，每千人拥有床位数6.55张。有医疗卫生专业技术人员5.62万人，每千人拥有医疗卫生专业技术人员7.27人。有全科医生（含乡村全科执业助理医师）4921人，每万人拥有全科医生6.37人。有注册护士2.43万人，每千人拥有注册护士3.14人。有农村订单定向医学生1041人。全市居民人均期望寿命83.15岁。